Testirani bošnjački rodovi koji pripadaju haplogrupi C nalaze se ispod njene mutacije M48 koja je nastala iz predačke grane L1373. Ova grana L1373 (C2a) nastala je iz haplogrupe C2 prije nekih 34.000 godina. Naziva se „sjevernom“ granom svog prethodnika, haplogrupe C2. Nalazimo je u populacijama od Centralne Azije do Sibira i američkog kontinenta, a nešto rjeđe u susjednim područjima kao što su Istočna Azija, Bliski Istok i Istočna Evropa. Njenoj podgrani F3447 pripada i drevni uzorak sa obala rijeke Selenge u ruskoj pokrajini Burjatiji, na granici s Mongolijom, a datira u vijreme od prije 14.000 godina. Testirani Bošnjaci pripadaju njenoj daljoj podgrani M48, poznatoj i kao C2a1a2. M48 je najviše zastupljena među današnjim narodima Tunguzije, ali je nalazimo i u Mongoliji, Alšinima u zapadnom Kazahstanu, među mongolskim Kalmicima u pokrajini Kalmikiji kod Kaspijskog jezera, kao i među izoliranim slučajevima u Turskoj. Svi testirani uzorci ispod M48 imaju zajedničkog pretka koji je živio prije 16.100 godina.
Ispod M48 je testirano šest bošnjačkih rodova iz srednjeg Polimlja u Sandžaku, tj. Bećirović i Halilović iz Prijepolja. Ispod njene nizvodne grane M86 je Banda iz Bijelog Polja. Nešto niže na filogenetskom stablu nalaze se Bećirović, Hodžić i Striković iz Prijepolja, tačnije ispod ogranka Z12825. Iako je ova grana mogla doći i ranije, npr. s Hunima u 5. ili s Mađarima u 9. ili 10. stoljeću, zbog njihovog odsustva među ostalim narodima Balkana, za pretpostaviti je da su njihovi preci na današnje područje došli s Osmanlijama.
